הסיפור הרחב יותר של הכיבוש ההודי האמריקאי של Alcatraz לפני 50 שנה יכול בקלות לכלול נתח גדול יותר של ההיסטוריה האמריקאית - עוד מהסכם מהמאה ה -19 ומכירת האי מנהטן בשנת 1626 ועד ימינו - אבל ציר הזמן הליבה החל בנובמבר 1969 ונמשך קצת יותר משנה וחצי.
לאחר ששריפה באוקטובר 1969 הרסה את המרכז ההודי האמריקאי בסן פרנסיסקו, קבוצה של פעילים החלה לדבר על השתלטות על האי אלקטרז, שהוכרז כשטח עודף בשנת 1964 לאחר סגירת הכלא שנה קודם לכן. קבוצה קטנה ראשונה של מפגינים שכללה את הסטודנט ריצ'רד אוקס מסן פרנסיסקו שטה לאי ב-9 בנובמבר ובילתה שם את הלילה לפני שהורחקה על ידי הרשויות.
ב-19 בנובמבר 1969, 89 פעילים תחת השם "אינדיאנים מכל השבטים" (הידועים רשמית כאינדיאנים של כל השבטים בע"מ), התאספו בבר ללא שם בסוסליטו והועברו באמצע הלילה על ידי סירות מקומיות שאוהדות את התנועה. בנימוק של אמנה משנת 1868 שאפשרה לאינדיאנים אמריקאים להשתלט על "אדמה פדרלית עודפת", כמו גם היסטוריה של כיבוש על אלקטרז על ידי כמה מהעמים הילידים המוקדמים ביותר באזור מפרץ סן פרנסיסקו, 14 המפגינים שהגיעו לחוף במסע הראשון תבעו את האי והחלו להקים את הכיבוש של בית הסוהר הפדרלי לשעבר.
מצור של משמר החופים על האי מנע מרוב הסירות לנחות במסע הראשוני, אך ככל שהסירות המשיכו לעבור, אוכלוסיית אלקטרז גדלה ל -600 אנשים בתוך חודשים. גורמים רשמיים בצוותו של הנשיא ריצ'רד ניקסון הציעו להסתער על האי עם מרשלים פדרליים, אך התעכבו מחשש לתקיפה מתוקשרת של קבוצה שכללה נשים וילדים.
על פי הצהרה שנמסרה לתקשורת ולפקידי ממשל על ידי המנהיג המתעורר ריצ'רד אוקס, האינדיאנים של כל השבטים השתלטו על האי, אך היו מוכנים לשלם "24 דולר בחרוזי זכוכית ובד אדום" עבור הנכס, הסכום שמתיישבים אירופאים שילמו לאינדיאנים אמריקאים עבור האי מנהטן. הקבוצה תכננה להקים מרכז תרבות ללימודי ילידי אמריקה, מוזיאון, מרכז רוחני ומרכז אקולוגי.
ביום השני על האי, המארגנים הקימו מרפאה. בסופו של דבר כלל הצוות שלושה רופאים מתנדבים ושתי אחיות, מה שאפשר לתת מענה למקרי חירום בכל שעות היממה. ב-11 בדצמבר 1969 פתחו האינדיאנים מכל השבטים את בית הספר ביג רוק, וקיבלו 12 תלמידי בית ספר יסודי (גן ילדים עד כיתה ו'), אם כי ההרשמה גדלה ל-22 תלמידים עד סוף החודש. תוכנית הלימודים כללה את רוב המקצועות הטיפוסיים — קריאה, מתמטיקה, גיאוגרפיה — וכן את ההיסטוריה, התרבות ואמנויות הילידים. סטודנטים עזבו מדי פעם את האי בטיולי שטח למוזיאון האמנות של אוקלנד, לפלנטריום מוריסון ולגן החיות של סן פרנסיסקו.
ב -22 בדצמבר, תחנת הרדיו ברקלי KPFA-FM החלה להפעיל שידור פריים טיים יומי מהאי, המכונה רדיו חינם Alcatraz, אשר שודר גם בתחנות השותפים של KPFA בניו יורק ובלוס אנג'לס. התכנות הדגיש את התרבות ההודית, כמו גם סוגיות פוליטיות וחברתיות באי ועם חברי שבטים בכל מקום. השידורים, בבימויו של ג'ון טרדל, סנטי סו מנברסקה, נמשכו עד סוף 1970.
בעוד שהתמיכה הציבורית הייתה חזקה בתחילה, כולל קבוצות איגוד וסלבריטאים כמו ג'יין פונדה, מרלון ברנדו והלהקה קרידנס קלירווטר רבייבל (שתרמה 15,000 דולר לסירה), המציאות של ניסיון לקיים קהילה גדולה על האי עם תשתית מזדקנת וללא מים מתוקים ניכרה יותר ויותר בתחילת 1970.
במקביל לכך שמנהיגי האינדיאנים מכל השבטים הגישו בקשה רשמית של המועצה הלאומית להזדמנות הודית למתקנים, ציוד, ציוד, אספקה רפואית ותחבורה כדי להפוך את האי למיושב יותר, גורמים רשמיים במנהל השירותים הכלליים הפדרלי - משגיחי האי - המשיכו לייעץ לאינדיאנים מכל השבטים ולתקשורת שהכובשים נחשבים ל"מסיגי גבול" וכי הממשלה הפדרלית "אינה לוקחת אחריות על ביטחונך בזמן אתה נשאר על האי הזה."
בינואר, בתו החורגת בת ה-13 של ריצ'רד אוקס, איבון, מתה מנפילה של כמה גרמי מדרגות. אוקס ומשפחתו עזבו את האי כדי להתאבל, והותירו מנהיגים אחרים של אינדיאנים מכל השבטים להשתלט על תכנון האי ועל משא ומתן עם הממשלה, שממנה התעקשו מנהיגי האינדיאנים האמריקאים על לא פחות מאשר שטר הקניין לאדמה וכסף לאוניברסיטה שם.
מנהיגי הכיבוש התמודדו עם קשיים הולכים וגוברים בקרב מבקרים שאינם הודים, בעיקר חברים בתרבות הסמים ההיפית של סן פרנסיסקו שנמשכו למטרה האנטי-ממשלתית וללינה חופשית. מנהיגי האינדיאנים של כל השבטים אסרו בסופו של דבר על לא-הודים לבלות את הלילה, אם כי בשלב זה אוכלוסיית חברי השבט כבר הייתה במגמת ירידה עם חזרת התלמידים לבית הספר. עד מאי 1970, הממשלה פעלה להעברת Alcatraz לפעול תחת סמכות השיפוט של משרד הפנים במטרה לכלול אותו במערכת הפארק הלאומי.
בעוד שהתנועה איבדה חלק מהתנופה הראשונית שלה עד אמצע 1970, תשומת הלב הציבורית שזכתה לה גרמה לבית הלבן של ניקסון ביולי לשים קץ למדיניות הממשלה של "הפסקת" ההטבות והקרקעות עבור אמריקאים הודים והנשיא אמר כי "הגדרה עצמית בקרב העם ההודי יכולה וצריכה להיות מעודדת ללא איום של סיום סופי". ביום השנה הראשון לכיבוש, האינדיאנים של כל השבטים ערכו מסיבת עיתונאים כדי לחשוף תוכניות לאוניברסיטת Thunderbird על האי.
בקיץ 1970, פקידים פדרליים ניתקו מים לאלקטרז. בתגובה, מנהיגי האינדיאנים מכל השבטים הודיעו כי יתחילו להציע סיורים באי כדי לגייס כסף לקניית בקבוקי מים ואספקה אחרת. גורמים רשמיים במנהל השירותים הכלליים מיהרו להודיע כי האי "אינו בטוח ומסוכן" וכי כל מסיגי גבול באי יועמדו לדין.
שריפות באלקטרז ביוני 1970 הרסו כמה מהמבנים העיקריים והפילו את המגדלור, שעדיין שימש לניווט במפרץ סן פרנסיסקו. התנגשות בינואר 1971 בין שתי ספינות מכליות, שהשליכו 800,000 גלונים של נפט גולמי ליד גשר שער הזהב, הואשמה בהיעדר מגדלור עובד באלקטרז, ושחקה עוד יותר את התמיכה הציבורית בכיבוש.
בתוך חודשים ספורים ניתקו גורמים רשמיים את החשמל האחרון לאי, ועד ה-11 ביוני 1971, כאשר אנשי סגל פדרליים הסתערו על האי, נותרו רק 15 בני אדם, חמישה מהם ילדים. הכיבוש עצמו אמנם לא השיג את מטרותיו המקוריות, אך הוא זוכה לשבחים רבים על כך שהוליד מאות מחאות אינדיאניות אמריקאיות אחרות ומודעות גוברת לנושאים קשורים בארצות הברית ובמקומות אחרים.
בשנת 1972, Alcatraz Island שולב באזור הפנאי הלאומי שער הזהב, חלק ממערכת הפארקים הלאומיים של ארצות הברית.