Transport af bagage
Proceduren for at blive ført gennem Ellis Island var lang og stressende for passagererne. Familierne skulle forlade dampskibet og gå ind i bagagerummet, som lå på bygningens hovedniveau. Passagererne fik udleveret nummererede identitetsmærker. Ejendele såsom vogne, tasker og skattekister fyldt med passagerernes vigtigste ting blev efterladt i bagagerummet, hvorefter passagererne fulgte deres stikord til registreringsrummet, der ligger oppe ad trappen, så passagererne kunne blive inspiceret af læger og retsembedsmænd. Vagterne undersøgte hver enkelt person individuelt for at se, om de havde åndenød, var svage til at gå eller havde svært ved at tale.
Sundhedsvurdering
Registry Room, der dengang også var kendt som "The Great Hall", var et smukt og rummeligt område, der var 200 fod langt og 102 fod bredt. Det var i dette rum, at passagererne fik at vide, om de kunne komme ind i landet eller blive sendt tilbage til deres oprindelige land. Mellem 1903 og 1914 var en sygdom kendt som "Trachoma", der ramte øjnene, meget udbredt i denne periode. Hvis nogen havde sygdommen på sig ved ankomsten, blev de ofte sendt tilbage til deres oprindelige land. Der blev ikke kun foretaget en vurdering af øjnene, men også en "seks sekunders kontrol" for at fastslå, om en passager var fysisk eller psykisk syg.
Den retlige procedure
I det samme lokale, hvor den fysiske kontrol blev udført, fandt også den juridiske inspektion sted. Der blev stillet 29 spørgsmål som f.eks.: "Hvor er du født?", "Hvad er dit erhverv?", "Er du gift?
